Механизм работы обоняния

Запахи и их восприятие
Способность ощущать запахи — одно из самых древних чувств. В отличие от зрения или слуха, где информация имеет волновую природу, обоняние имеет дело с дискретными ощущениями, с практически бесконечным миром молекул ароматических веществ, плавающих в воздухе. Как мозг различает аромат розы от запаха жареного мяса? Как мы способны опознать один-единственный знакомый запах среди тысяч других? Эта задача казалась настолько сложной, что долгое время обоняние оставалось «черным ящиком».
В конце 30-х была предложена «вибрационная» теории (Малкольм Дайсон, 1938г), которая продержалась до 50-х годов, вытесненная впоследствии теорией «замка и ключа». Но ни первая, ни вторая не объясняла, как физически и химически происходит взаимодействие рецептора с одорантом, и какие структуры лежат в основе этого процесса.
Прорыв, случившийся на рубеже 1990-х годов, не только вскрыл механизмы этого процесса, но и представил миру одно из самых элегантных и грандиозных творений эволюции - семейство обонятельных GPCR-рецепторов.
Ричард Аксель и Линда Бак (*1) подошли к проблеме с довольно простой идеей: если обонятельные рецепторы существуют, то их гены должны быть активны только в обонятельном эпителии и должны принадлежать к большому семейству родственных последовательностей. Используя метод ПЦР и в качестве зонда — консервативные участки генов уже известных GPCR (например, β-адренорецептора), они провели скрининг ДНК обонятельного эпителия крысы.
Результат оказался неожиданным. Вместо одного или нескольких генов они обнаружили около тысячи различных, но эволюционно связанных генов. Это было крупнейшее семейство генов, когда-либо найденное у млекопитающих. Последовательности этих генов однозначно указывали на то, что они кодируют белки, принадлежащие к сверхсемейству GPCR — семи-трансмембранным рецепторам, которые передают сигнал внутрь клетки через G-белки.
Это открытие, удостоенное в 2004 году Нобелевской премии по физиологии и медицине, имело фундаментальные последствия: оно дало материальную основу обонянию, объяснило широту обонятельного спектра, связало обоняние с фундаментальными клеточными процессами.
Как устроено обоняние?
Обонятельный рецептор (OR) — это белковая машина, встроенная в мембрану специализированного обонятельного нейрона в носовой полости. Структура рецептора типична для GPCR: полипептидная цепь семь раз пронизывает клеточную мембрану, создавая сложную трехмерную структуру с тремя внеклеточными и тремя внутриклеточными петлями.

Внеклеточный домен формирует карман для связывания лиганда, т.е. в случае OR-рецептора - молекулы одоранта. Этот карман не является жестким; он обладает определенной пластичностью, что позволяет одному рецептору связывать несколько разных, но структурно сходных молекул. Специфичность определяется взаимодействиями (водородными связями, вандерваальсовыми силами) между аминокислотами кармана и атомами одоранта. Трансмембранные спирали выполняют роль молекулярного переключателя. Связывание одоранта вызывает микросмещение спиралей относительно друг друга, переводящее рецептор из неактивного состояния (R) в активное состояние (R*). Внутриклеточный домен в активном состоянии меняет свою конформацию так, что приобретает высокое сродство к G-белку. В обонятельных нейронах это специфический G-белок, т.н. G(olf)
Сигнальный каскад выглядит следующим образом:
-
Молекула одоранта попадает во внеклеточный домен.
-
После присоединения этого лиганда рецептор в мембране обонятельного нейрона меняет конформацию своего внутриклеточного домена. И внутриклеточный домен становится чувствительным к гетеротримерному G-белку G(olf), состоящему из трех субъединиц. Когда G-белок присоединяется к внутриклеточному домену GPCR рецептора, он в свою очередь активируется.
-
Активированный G-белок, отсоединяет от себя alpha-субъединицу, которая отправляется в «свободное плавание» по цитоплазме клетки. Эта субъединица, в свою очередь, запускает фермент адененилатциклазу III, которая производит множество молекул вторичного мессенджера — циклического АМФ (цАМФ). В то же время сам G-белок отсоединяется от внутреннего сайта GPCR рецептора, уступая место новому G-белку с полным набором из трех субъедениц. Таким образом цикл повторяется до тех пор, пока GPCR рецептор активирован лигандом, при этом сигнал многократно усиливается.
-
цАМФ напрямую открывает ионные каналы в мембране, позволяя положительно заряженным ионам Na+, Ca2+) войти в клетку. Это вызывает электрический сигнал — потенциал действия.
-
Потенциал действия по аксону нейрона передается в мозг, в обонятельную луковицу.
Эта каскадная система обеспечивает колоссальное усиление сигнала: одна-единственная молекула лиганда (одоранта) может привести к открытию тысяч ионных каналов, генерируя мощный нервный импульс.
Надо отметить, что в отдельно взятом обонятельном нейроне экспрессируется ТОЛЬКО ОДИН тип GPCR рецепторов. Соответственно, чем больше концентрация молекул пахнущего вещества, тем больше однотипных нейронов в эпителии активируется этими молекулами и тем сильнее воспринимается сила запаха.
Происхождение обоняния
При всей своей сложности, описанная схема работы рецепторов сформировалась еще у самых ранних челюстноротых позвоночных несколько сотен миллионов лет назад. Первоначальной функцией рецепторов было обнаружение водорастворимых сигнальных молекул: пуринов (напр. АТФ - сигнал повреждения тканей), простагландинов (половые феромоны у рыб), аминокислот (сигналы наличия пищи). И что интересно, около 50-60 «рыбьих» рецепторов сохранилась и у современных наземных позвоночных, включая человека. Эти рецепторы образуют Класс I (OR-I) («рыбьи» или «водные» рецепторы ). Хотя их роль менее изучена, они, вероятно, адаптировались для детекции некоторых короткоцепочечных жирных кислот (продуктов брожения, компонентов пота) и, возможно, выполняют специфические функции в необонятельных тканях.
Класс II (OR-II) – это «тетраподные» или «воздушные» рецепторы, которые составляют основу обоняния наземных животных и предназначенные для детектирования летучих молекул, переносимых по воздуху. Класс II включает большую часть рецепторов, настроенных на все многообразие запахов, которые мы ассоциируем с окружающим миром. У человека к этому классу принадлежат около 350 рецепторов.
Как происходит опознавание запахов?
Самое элегантное решение, которое нашла эволюция, это принцип комбинаторного кодирования. Он разрешил парадокс: как ограниченное число рецепторов (сотни) может кодировать практически неограниченное число запахов (десятки тысяч).
В основе принципа лежат следующие два принципа:
-
Один рецептор может быть активирован множеством разных одорантов. Например, рецептор OR55 реагирует на целый ряд карбоновых кислот разной длины (C5-C10). Он не обладает абсолютной специфичностью.
-
Один одорант активирует свой уникальный набор рецепторов. Молекула, скажем, гераниола, может сильно активировать рецепторы A, B и C, слабо - рецептор D, и не влиять на все остальные.
Таким образом запах индивидуального вещества кодируется в мозге не как активность одного нейрона, а как уникальный паттерн возбуждения всей популяции обонятельных нейронов. Мозг, получая этот паттерн, интерпретирует его как целостное восприятие - «запах корицы» или «аромат свежескошенной травы».
Запах смеси веществ также воспринимается как паттерн, но только более сложный, в котором задействовано гораздо больше нейронов.
Соответственно, в узнавании запаха действуют те же механизмы, что и при распознавание зрительных образов. Характерный паттерн активности 400 типов олфакторецепторов – это тот же образ, который можно опознать и сравнить с уже известными паттернами.

Этот механизм обладает всеми свойствами, необходимыми стабильной сенсорной системе:
-
Высокой чувствительностью. Иногда нескольких молекул одоранта достаточно, чтобы запустить каскад реакций, приводящих к нервному импульсу. Особенно это касается феромонов у насекомых;
-
Высокой разрешающая способностью. Система может различить очень тонкие нюансы и отличия в похожих запахах, выделять отдельные ноты запаха;
-
Помехоустойчивостью. Оказалось, что гены олфакторецепторов - одни из самых вариабельных в нашем геноме. У разных людей они могут содержать однонуклеотидные полиморфизмы (SNP), которые меняют одну аминокислоту в критическом участке белка. Это приводит к тому, что один и тот же рецептор у разных людей может по-разному связывать один и тот же одорант. Однако, даже если один из типов рецепторов в ансамбле не работает из-за полиморфизма, общий паттерн может остаться узнаваемым, т.к. почти никогда не происходит взаимодействия с одним типом рецепторов
-
Контролем интенсивности. Сила запаха кодируется не силой активации одного рецептора, а общим количеством активированных нейронов и частотой их возбуждения.
Каковы направления исследований в этой области?
Современные исследования в области восприятия запаха сфокусированы на двух основных направлениях: определение 3D-структуры рецепторов и понимание индивидуальных различий в восприятии запаха.
Экспериментальное исследование структуры белков основано на рентгеноструктурном анализе. Но для проведения таких исследований было необходимо получать белок к кристаллическом виде.
Долгое время получение кристаллов мембранных белков, к которым относятся олфакторецепторы, было неразрешимой задачей. Прорыв произошел с развитием криоэлектронной микроскопии (cryo-EM), позволившей «видеть» белки в почти нативном состоянии. В 2023-2024 годах были опубликованы первые высокодетализированные структуры человеческих олфакторецепторов в комплексе с их лигандами.
Эти структуры показывают
-
подробную архитектуру лиганд-связывающего кармана, т.е. какие аминокислоты непосредственно контактируют с одорантом;
-
как смещение одной трансмембранной спирали на несколько ангстрем запускает глобальную перестройку всего белка и происходит его активация;
-
причины высокой селективности: почему, например, рецептор OR5A1 связывает β-ионон (фиалка), но игнорирует линалоол (лаванда).
Самое главное, что при этом появилась возможность узнать 3D структуру молекулярного GPCR рецептора в активированном состоянии, т.е. в тот момент, когда он соединен с лигандом.
Экспериментальное определение структуры белков – сложная и очень дорогая задача, поэтому исследования 3D структуры белков продвигались медленно. И только с появлением системы искусственного интеллекта AlphaFold от Google DeepMind в этом направлении произошел прорыв, за который разработчики Демис Хассабис и Джон Джампер были удостоены Нобелевской премии.
Первоначально 3D cтруктуры, полученные с использованием второй версий алгоритма Alpha-fold, отражали только неактивное состояние рецептора, вытекающее просто из аминокислотной последовательности белка. Соответственно, эксперименты с молекулярным докингом (напр. https://bioserv.rpbs.univ-paris-diderot.fr/services/SeamDock/) лигандов-одорантов с использованием 3D структур олфакторецепторов, полученных с помощью AlphaFold 2 давали неудовлетворительные результаты: рецепторы как будто не проявляли избирательности к тем лигандам, с которыми они, по идее, должны были активно взаимодействовать.
В мае 2024 г вышла новая версия AlphaFold 3 которая, хоть и с довольно большими ограничениями, могла создавать структуры, отражающие влияние лигандов.
Но гораздо более достоверные результаты, близкие к данным криоэлектронной микроскопии, дает появившаяся в 2023г сторонняя модификация к AlphaFold 3 AlphaFold-MultiState, позволяющие прогнозировать структуру рецептора в активном состоянии, т.е непосредственно в состоянии связанности с лигандом.
Так же хорошие результаты для взаимодействия GPCR рецепторов с низкомолекулярными лигандами показывает программа RoseTTAFold от другого разработчика.
Информация о найденных с помощью новых инструментов структурах GPCR-рецепторах аккумулируется в базах данных, таких как GPCRdb (https://gpcrdb.org)
В частности, в 2025 глобальная база данных по рецепторам GPCRdb выпустила большое обновление (*2). Теперь она включает обонятельные рецепторы (ORs) и предлагает новые инструменты для работы с ароматическими веществами на структурном уровне. В базу добавлен полный набор человеческих ORs с унифицированной классификацией, а также их ортологи (эволюционно родственные рецепторы) у важных модельных животных (мышь, крыса, собака, обезьяна). Это создаёт единую справочную систему. Созданные с помощью упомянутых инструментов (AlphaFold-MultiState, а также RoseTTAFold) структуры интегрированы в базу. Это даёт наглядное представление о том, как молекулы (включая потенциальные ароматические соединения) взаимодействуют со своими рецепторами в пространстве, что полезно для понимания специфичности и механизма действия. Существенно расширен функционал поиска в базе лигандов. Теперь можно выполнять сложные запросы: поиск по точной структуре (SMILES), по фрагменту (SMARTS), а также по структурному сходству. Это мощный инструмент для скрининга и анализа библиотек ароматических молекул. Новый инструмент на базе алгоритма Foldseek позволяет искать рецепторы, похожие именно по трёхмерной архитектуре (а не только по последовательности ДНК). Это может помочь обнаружить рецепторы со сходными активными центрами в отношении конкретного лиганда и таким образом дает возможность предсказывать новые рецепторы-мишени. Разработан инструмент «Data Mapper» , который позволяет загружать ваши экспериментальные данные и накладывать их на интерактивные карты рецепторов (кластерные диаграммы, тепловые карты), облегчая анализ и выявление закономерностей.
База данных эволюционировала в сторону удобства для прикладных исследователей, предлагая конкретные, наглядные и мощные инструменты для работы с мишенями и лигандами.
Практическое применение исследований
Знания о структуре и работе олфакторецепторов уже сегодня выходят за стены научных лабораторий и находят применение в самых разных сферах.
Целевой дизайн новых лекарственных веществ на основе расчетов взаимодействий лигандов с рецепторами используется уже давно. Вместо дорогостоящего и длительного перебора тысяч натуральных и синтетических молекул, компании используют виртуальный скрининг. На компьютере моделируется структура рецептора-мишени, и из библиотек соединений отбираются те, что идеально к нему подходят. Такой же подход пытаются использовать для разработки новых одорантов для парфюмерии. Это в разы ускоряет их создание. Доступны библиотеки, облегчающие проведение таких исследований (https://pyrfume.org)
Попытки создать «искусственный нос» ведутся давно, но старые технологии были недостаточно избирательны. Сегодня инженеры пытаются интегрировать сами обонятельные рецепторы (или их стабильные аналоги) в микрочипы (см. https://koniku.com). Такие биосенсоры могли бы с высокой чувствительностью обнаруживать
-
взрывчатые вещества в аэропортах или на поле военных действий;
-
наркотики;
-
патогены (некоторые бактерии и грибы производят характерные летучие молекулы) в медицине и пищевой промышленности;
-
ранние признаки порчи продуктов;
-
маркеры заболеваний в выдыхаемом воздухе (например, ацетон при диабете).
Изучение того, как именно нарушается работа обонятельной системы, может привести к созданию простых и неинвазивных диагностических тестов для диагностики нейродегенеративных заболеваний типа болезни Паркинсона и Альцгеймера. Известно, что потеря обоняния (аносмия) - один из самых ранних симптомов этих болезней.
Заключение
Таким образом, обонятельная система представляет собой уникальный и эволюционно древний сенсорный канал, играющий ключевую роль в выживании и адаптации живых организмов. Её происхождение уходит корнями в фундаментальные механизмы химической коммуникации, а устройство, основанное на комбинаторном кодировании запахов рецепторными нейронами и пространственной проекцией в обонятельные луковицы, демонстрирует высокую эффективность в распознавании бесчисленного множества одорантов.
Полученные знания уже сегодня находят применение в создании электронных носов для медицины, экологического мониторинга и обеспечения безопасности, в разработке методов ранней диагностики нейродегенеративных заболеваний, в продвинутых маркетинговых и пищевых технологиях, а также в ароматерапии. Дальнейшее изучение обонятельной системы обещает не только раскрыть новые тайны работы сознания, но и привести к революционным прорывам в науке, медицине и технологиях, улучшающих качество жизни человека.
---
-
* Linda Buck, Richard Axel, A novel multigene family may encode odorant receptors: A molecular basis for odor recognition, Cell, Volume 65, Issue 1, 1991, Pages 175-187, ISSN 0092-8674, https://doi.org/10.1016/0092-8674(91)90418-X. (https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/009286749190418X).
-
* Luis P Taracena Herrera, Søren N Andreassen, Jimmy Caroli, Ismael Rodríguez-Espigares, Ali A Kermani, György M Keserű, Albert J Kooistra, Gáspár Pándy-Szekeres, David E Gloriam, GPCRdb in 2025: adding odorant receptors, data mapper, structure similarity search and models of physiological ligand complexes, Nucleic Acids Research, Volume 53, Issue D1, 6 January 2025, Pages D425–D435, https://doi.org/10.1093/nar/gkae1065
Автор статьи: Соколов Виталий Борисович, к.х.н, флейворист, вице-президент ICPF
